Will semakin jauh memasuki dunia bawah tanah. Bersama Cal dan Chester, mereka berhadapan dengan kondisi yang sangat berbahaya: dikejar-kejar Limiter--divisi pasukan khusus Styx yang terkenal kejam--beserta anjing pelacak mereka yang sama kejamnya, para pemberontak, dan berbagai kondisi alam serta makhluk-makhluk aneh yang mengancam keselamatan mereka.
Ternyata, Styx sudah mulai mewujudkan rencana mereka, mengirim wabah ke dunia atas, berusaha memusnahkan Topsoiler dan merebut kembali tanah yang mereka janjikan.
Will tidak pernah menduga, perjalanannya di Deeper akan membawanya bertemu dengan hal-hal tak terduga. Dan perjalanannya belum berakhir, karena dia belum bertemu dengan Dr. Burrows.