Implementasi Metode Ensemble pada Klasifikasi Inhibitor CDK2 sebagai Agen Anti Kanker

MELA MAI ANGGRAINI

Informasi Dasar

20.04.3756
000
Karya Ilmiah - Skripsi (S1) - Reference

Pengobatan kemoterapi secara jangka panjang memiliki efek samping dan resistensi sel terhadap obat tertentu. Oleh karena itu, dibutuhkan obat baru yang dapat mengurangi efek samping dan memberikan efek pengobatan yang lebih baik. Pada umumnya, obat-obat anti kanker dikembangkan dengan mempertimbangkan Cyclin Dependent Kinase 2 (CDK2) sebagai targetnya. Desain obat secara konvensional diketahui tidak efektif dan efisien karena untuk mendapatkan senyawa baru dengan aktivitas biologis tertentu perlu dilakukan sintesis terlebih dahulu untuk mengetahui aktivitasnya. Untuk mendesain obat baru, dibutuhkan suatu model yang dapat memprediksi aktivitas kandidat obat. Proses prediksi tersebut dapat dilakukan dengan menggunakan suatu model matematika yang dapat menentukan korelasi struktur dan aktivitas atau dikenal dengan Quantitative Structure-Activity Relationships (QSAR). Penelitian ini bertujuan membangun model prediksi untuk klasifikasi dengan metode ensemble yaitu XGBoost, Random Forest dan Adaboost. Penelitian dilakukan dengan mengimplementasikan metode ansambel tersebut pada setiap fingerprint (Estate, Extended, Maccs dan Pubchem). Berdasarkan hasil yang didapatkan, Random Forest dengan fingerprint Pubchem merupakan model prediksi terbaik dibandingkan dengan metode lainnya. Hal ini ditunjukkan dengan nilai Matthews Correlation Coefficient (MCC) dan Area Under the ROC Curve (AUC) yang paling besar yaitu berturut-turut, MCC=0.979 dan AUC=0.999.

Subjek

Machine Learning
 

Katalog

Implementasi Metode Ensemble pada Klasifikasi Inhibitor CDK2 sebagai Agen Anti Kanker
 
 
 

Sirkulasi

Rp. 0
Rp. 0
Tidak

Pengarang

MELA MAI ANGGRAINI
Perorangan
Isman Kurniawan, Erwin Budi Setiawan
 

Penerbit

Universitas Telkom
 
2020

Koleksi

Kompetensi

 

Download / Flippingbook

 

Ulasan

Belum ada ulasan yang diberikan
anda harus sign-in untuk memberikan ulasan ke katalog ini