Robert Langdon, profesor simbologi terkemuka, melakukan perjalanan ke Praha untuk menghadiri kuliah terobosan yang disampaikan oleh Katherine Solomon, ilmuwan noetik ternama yang baru saja menjalin hubungan dengannya. Katherine berada di ambang menerbitkan buku kontroversial berisi penemuan-penemuan mengejutkan tentang hakikat kesadaran manusia yang dapat mengguncang keyakinan berabad-abad. Namun, sebuah pembunuhan brutal mengacaukan perjalanan itu, dan Katherine tiba-tiba menghilang bersama naskah bukunya.
Langdon mendapati dirinya menjadi target organisasi berpengaruh dan diburu oleh sosok mengerikan yang seolah-olah muncul dari mitologi tertua Praha. Ketika alur cerita berpindah ke London dan New York, Langdon mati-matian mencari Katherine, sekaligus mencari jawaban. Dalam perlombaan menegangkan menyusuri dua dunia, ilmu pengetahuan futuristik dan pengetahuan mistis, dia mengungkap sebuah kebenaran mencengangkan tentang proyek rahasia yang akan selamanya mengubah cara kita memandang pikiran manusia.
"The Secret of Secrets merupakan karya paling ambisius Dan Brown: thriller yang padat sekaligus perenungan tentang kesadaran manusia dan kemungkinan masa depannya."